Die Therapie des Morbus Crohn richtet sich nach Stadium, Komplikationen und Ausbreitung der Erkrankung. Ziele sind eine wirksame Symptomkontrolle, eine anhaltende Unterdrückung der Entzündung möglichst bis zur Inaktivität, sowie die Vorbeugung schwerwiegender Komplikationen. Eine klinische Heilung ist möglich.